Αυτές οι επιτυχίες με την τοπική ομάδα της Γρανάδα οδήγησαν τον Μόντσι, τότε τεχνικό διευθυντή της Σεβίλλης, να τον εντάξει στην ομάδα του. Αρχικά στον τομέα της μεθοδολογίας και στη συνέχεια προπονητή στη Σεβίλλη Γ’ και στην ομάδα Νέων, με την οποία κατέκτησε το πρωτάθλημα το 2012. Ακολούθησε ο προβιβασμός του στην πρώτη ομάδα, με την οποία το 2014 ως μέλος του προπονητικού επιτελείου, υπό την καθοδήγηση του Ουνάι Έμερι, κατακτήθηκε το Europa League. Το 2014 ανέλαβε τη δεύτερη ομάδα της Σεβίλλης, την οποία αρχικά οδήγησε στην παραμονή και τη σεζόν 2015-2016 στον προβιβασμό στη Segunda División (δεύτερη κατηγορία).
Τον Ιούνιο του 2017 ανέλαβε την τεχνική ηγεσία της Οσασούνα και τον Ιούνιο του 2018 εκείνη της Γρανάδα, με την οποία πέτυχε την απευθείας άνοδο στην πρώτη κατηγορία του ισπανικού ποδοσφαίρου, με αποτέλεσμα να λάβει το βραβείο «Trofeo Miguel Muñoz», ως ο καλύτερος προπονητής της Segunda División. Την αγωνιστική περίοδο 2019-2020, ως ο νεότερος τεχνικός στη La Liga, κατόρθωσε να γράψει ιστορία με τη Γρανάδα, αφού για πρώτη φορά το κλαμπ της Ανδαλουσίας εξασφάλιζε έξοδο σε ευρωπαϊκή διοργάνωση (Europa League). Την ίδια σεζόν έφτασε με τη Γρανάδα έως τα ημιτελικά του ισπανικού Κυπέλλου (Copa del Rey), γνωρίζοντας από την Αθλέτικ Μπιλμπάο τον αποκλεισμό για τον τελικό λόγω του κανονισμού των εκτός έδρας γκολ. Το 2020-2021 κατέλαβε με τη Γρανάδα την ένατη θέση στη La Liga και την έφτασε έως τους «8» του Κυπέλλου και του Europa League.
Τον Μάιο του 2022 ανακοινώθηκε η πρόσληψή του στην Εσπανιόλ, την οποία καθοδήγησε σε 27 αγώνες στη La Liga και σε τέσσερις στο Copa Del Rey. Τον Απρίλιο του 2023 αποχώρησε από την ομάδα της Βαρκελώνης.