Το καταστατικό του νέου συλλόγου εγκρίθηκε στις 26 Απριλίου 1926 από το Πρωτοδικείο Θεσσαλονίκης (αριθ. απόφασης 822/26). Η ημερομηνία αυτή θεωρείται και η ληξιαρχική πράξη γέννησης του συλλόγου, αλλά η αγωνιστική του δράση είχε ξεκινήσει ένα χρόνο νωρίτερα. Ως χρώματα της ομάδος επιλέχθηκαν το πένθιμο μαύρο για να συμβολίζει την τραγική περιπέτεια του μικρασιατικού ελληνισμού και το αισιόδοξο λευκό, που θα άνοιγε ένα παράθυρο στο μέλλον. Έμβλημα του συλλόγου, το πράσινο τετράφυλλο τριφύλλι και το πέταλο.
Στις 26 Ιουλίου 1925 ο ΠΑΟΚ δίνει το πρώτο του φιλικό παιγνίδι και ηττάται 2-1 από τον Ηρακλή. Δύο εβδομάδες αργότερα θα συντριβεί από τον Άρη με 5-2. Το πρώτο επαγγελματικό συμβόλαιο της ομάδας υπογράφεται στις 5 Σεπτεμβρίου 1928, με τον ποδοσφαιριστή Ετιέν, που θα εισπράττει 4.000 δραχμές μηνιαίως.
Στις 20 Μαρτίου 1929 ο ΠΑΟΚ συγχωνεύεται με το άλλο προσφυγικό σωματείο της Θεσσαλονίκης, την ΑΕΚ, με πρωτοβουλία του γιατρού Καραμαούνα, προέδρου του πολιτιστικού σωματείου Ένωση Κωνσταντινοπουλιτών. Ο ΠΑΟΚ αλλάζει έμβλημα και στη θέση του τετράφυλλου τριφυλλιού με το πέταλο, υιοθετείται ο Βυζαντινός Δικέφαλος Αετός. Μόνο που ο Δικέφαλος Αετός του ΠΑΟΚ έχει τα φτερά του κλειστά, σε ένδειξη πένθους για τον ξεριζωμό των ρωμιών από την Πόλη.
Η πρώτη έδρα της ομάδας είναι το γήπεδο Συντριβανίου, που εγκαινιάζεται στις 12 Δεκεμβρίου 1930. Ακολουθεί φιλικό παιγνίδι με τον Άρη, που έληξε με νίκη του ΠΑΟΚ με 2-1. Ο ΠΑΟΚ συμμετέχει στο τοπικό πρωτάθλημα Θεσσαλονίκης και αναδεικνύεται πρωταθλητής τις χρονιές 1932, 1939 και 1948, ενώ δίνει το παρόν και σε ένα τελικό Κυπέλλου Ελλάδος το 1939.
Το φθινόπωρο του 1959 ξεκινά το νέο πρωτάθλημα της Α’ Εθνικής, με τον ΠΑΟΚ να είναι πανέτοιμος, με ισχυρή ομάδα και νέο γήπεδο στην Τούμπα, που εγκαινιάζεται στις 6 Σεπτεμβρίου. Χτίστηκε σε οικόπεδο 30 στρεμμάτων, που είχε παραχωρήσει το 1957 ο Στρατός στην Τούμπα, μια προσφυγική συνοικία της Θεσσαλονίκης. Στον πρώτο αγώνα του στην Α’ Εθνική, στις 25 Οκτωβρίου 1959, ο ΠΑΟΚ νικά τον Μέγα Αλέξανδρο Κατερίνης με 3-1.
Ο ΠΑΟΚ θα κάνει αισθητή την παρουσία του στο ελληνικό ποδόσφαιρο τη δεκαετία του 1970. Με παίκτες, όπως οι Κούδας, Σαράφης, Γκουερίνο, Παρίδης, Τερζανίδης, Ιωσηφίδης κ.α. κατέκτησε το 1972 και το 1974 τα δύο πρώτα Κύπελλα Ελλάδος και στις 23 Μαΐου 1976 το πρώτο του πρωτάθλημα, σπάζοντας την κυριαρχία των ομάδων του Κέντρου με προπονητή τον Γκιούλα Λόραντ. Το ίδιο διάστημα έδωσε το παρών σε πέντε ακόμη τελικούς (1970, 1971, 1973, 1977, 1978). Στην Ευρώπη ξεχωρίζει η πορεία του στο Κύπελλο Κυπελλούχων την περίοδο 1973-74. Έφθασε ως τα προημιτελικά, όπου αποκλείστηκε από τη Μίλαν (3-0, 2-2).
Τη δεκαετία του 1980 ο ΠΑΟΚ θα κατακτήσει ένα ακόμη πρωτάθλημα (1985), με τεχνικό τον Βάλτερ Σκότσικ και παίχτες, όπως οι Σκαρτάδος, Κωστίκος, Δημόπουλος, Ιωσηφίδης και Βασιλάκος. Θα φθάσει σε τρεις τελικούς Κυπέλλου Ελλάδος (1981, 1983 και 1985). Το 1983 θα έχει δύο αξέχαστες αναμετρήσεις με την Μπάγερν για το Κύπελλο UEFA, όπου θα πέσει ηρωικά (0-0, 0-0 και 9-8 στα πέναλτι υπέρ των Βαυαρών).
Η συνέχεια, όμως, δεν θα είναι ανάλογη. Οι αδύναμες διοικήσεις, τα οικονομικά προβλήματα και ο υπέρμετρος γιγαντισμός των οπαδών, που λύνουν και δένουν στην Τούμπα, καθιστούν τον ΠΑΟΚ από πρωταγωνιστή, κομπάρσο, παρά τις κάποιες επιτυχίες, όπως τα δύο Κύπελλα Ελλάδος (2001 και 2003), τη συμμετοχή στον τελικό του Κυπέλλου Ελλάδας το 1992 και τον αποκλεισμό της Άρσεναλ στο Κύπελλο UEFA το 1997 (1-0 και 1-1).
Από το καλοκαίρι του 2012 τις τύχες του ΠΑΟΚ ανέλαβε ο Eλληνορώσος επιχειρηματίας Ιβάν Σαββίδης, φιλοδοξία του οποίου ήταν να επαναφέρει τον «δικέφαλο του βορρά» στην κορυφή του ελληνικού ποδοσφαίρου. Επτά χρόνια αργότερα, η ομάδα της Θεσσαλονίκης κέρδισε το πρώτο της πρωτάθλημα, ύστερα από 34 χρόνια με προπονητή τον Ρουμάνο Ραζβάν Λουτσέσκου. Τα προηγούμενα χρόνια είχε κατακτήσει και 2 Κύπελλα Ελλάδας (2017, 2018).
Συνολικά, ο ΠΑΟΚ έχει κατακτήσει τρία πρωταθλήματα Ελλάδας (1976, 1985, 2019) και έξι Κύπελλα Ελλάδας (1972,1974, 2001, 2003, 2017, 2018,2019)
Ο ΠΑΟΚ, εκτός από το τμήμα του ποδοσφαίρου, διατηρεί
Αμρ Ουάρντα ΠΑΟΚ: Ο Αιγύπτιος επιθετικός δε βλέπει με θετικό μάτι την παραμονή των δικαιωμάτων του στον ΠΑΟΚ, αντιθέτως τα ρεπορτάζ τον θέλουν να να απαντά αρνητικά στη πρόταση για επέκταση της συνεργασίας των δύο πλευρών.
ΠΑΟΚ - Ολυμπιακός: Απίστευτο ντέρμπι στην Τούμπα με τον Ολυμπιακό να προηγείται 0-2 στο 9', τον ΠΑΟΚ να έχει ισοφαρίσει σε 2-2 μέχρι το 12' και τελικά να παίρνει και τη νίκη με 3-2 με πέναλτι του Πέλκα, χωρίς ουσιαστικά να έχει δημιουργήσει καμία ευκαιρία σε όλο το παιχνίδι - Ο Ολυμπιακός έχασε πολλές ευκαιρίες να τελειώσει από το πρώτο παιχνίδι την πρόκριση και οι δύο ομάδες θα λύσουν τις διαφορές τους στο "Στάδιο Καραϊσκάκη".
AEK - Άρης: Με γκολ του Μάνταλου και του Βράνιες, η ΑΕΚ επικτάτησε 2-1 του Άρη στο ΟΑΚΑ και έκανε το πρώτο βήμα για να βρεθεί στο τελικό του Κυπέλλου.
Ζαν Μπατίστ Λεό: Στο στόχαστρο του Ολυμπιακού, του Άρη και του ΠΑΟΚ φαίνεται πως έχει μπει ο Ζαν Μπατίστ Λεό.
Γιώργος Σκαρτάδος: Μια εικόνα που δείχνει τον παλαίμαχο άσσο του ΠΑΟΚ να ψήνει σουβλάκια έξω από την Τούμπα, κάνει το γύρο του διαδικτύου.
Σωτήρης Παπαγιαννόπουλος μεταγραφή: Μια ανάσα από την Τζουργκάρντεν βρίσκεται ο Σωτήρης Παπαγιαννόπουλος.
Φερνάντο Σάντος ΠΑΟΚ: Οι άνθρωποι των πρωταθλητών θα ήθελαν πολύ τον Πορτογάλο τεχνικό ή έναν άλλο προπονητή αντίστοιχης φιλοσοφίας.
Άρσεναλ - Ολυμπιακός: Ο Ολυμπιακός πέτυχε μια επική νίκη - πρόκριση στο Λονδίνο και ο επίσημος λογαριασμός του συλλόγου στο youtube παρουσιάζει ένα βίντεο με όσα δεν είδατε από την τηλεοπτική κάλυψη.
ΠΑΟΚ - Ολυμπιακός Ζοζέ Σα: Ο τραυματισμός του Πορτογάλου τερματοφύλακα στο κεφάλι στην πρόσφατη αναμέτρηση των Πειραιωτών με τον Παναιτωλικό κρίνει αμφίβολη τη συμμετοχή του για τον πρώτο μεγάλο ημιτελικό του κυπέλλου με τον ΠΑΟΚ στη Τούμπα.
