Υπό την ευθύνη του Υπουργείου Οικονομικών, βρίσκονται, μεταξύ άλλων, οι φορολογικές και τελωνειακές αρχές, το Γενικό Λογιστήριο του Κράτους, οι Δημόσιες Επιχειρήσεις και Οργανισμοί (Δ.Ε.Κ.Ο.), ο Οργανισμός Διαχείρισης Δημοσίου Χρέους (Ο.Δ.ΔΗ.Χ.), η Διεύθυνση Διαχείρισης Δημόσιου Υλικού (ΔΔΔΥ), η Ανεξάρτητη Αρχή Δημοσίων Εσόδων (ΑΑΔΕ), το Ταμείο Αξιοποίησης Ιδιωτικής Περιουσίας του Δημοσίου (Τ.Α.Ι.ΠΕ.Δ.) και οι αποκρατικοποιήσεις γενικότερα, η Ειδική Γραμματεία Διαχείρισης Ιδιωτικού Χρέους και το Γενικό Χημείο του Κράτους. Είναι το 1ο στη σειρά τάξης των Υπουργείων, σύμφωνα με την Απόφαση Πρωθυπουργού Αριθ. Υ1/2019 (ΦΕΚ 2901/Β/9-7-2019).
Στις 21 Μαρτίου 2002 με το Προεδρικό Διάταγμα 81/2002, μετά από πρόταση του Πρωθυπουργού Κώστα Σημίτη, το Υπουργείο Οικονομικών συγχωνεύθηκε με το Υπουργείο Εθνικής Οικονομίας στο Υπουργείο Οικονομίας και Οικονομικών. Στις 7 Οκτωβρίου 2009 με το Π.Δ. 185/2009, μετά από πρόταση του Πρωθυπουργού Γιώργου Παπανδρέου, το Υπουργείο Οικονομικών ανασυστάθηκε με απόσπαση των υπηρεσιών του από το Υπουργείο Οικονομίας και Οικονομικών.